Trên thị trường vận tải thủy khu vực phía Nam và đi tuyến Campuchia, SOWATCO được đánh giá là nhà cung cấp dịch vụ hàng đầu. Đặc biệt là vận chuyển container bằng đường thủy nội địa với thị phần chiếm 50% khu vực ĐBSCL với vận tải loại hàng có khối lượng lớn với đa dạng loại hình vận chuyển như vận chuyển nhanh (bằng tàu tự hành) và vận chuyển giá thấp (bằng tàu kéo). Về giá cả dịch vụ vận tải của SOWATCO được cho là rất cạnh tranh.SOWATCO được đánh giá là đơn vị có đội tàu vận tải đường thủy nội địa mạnh nhất khu vực phía Nam cùng với bến cảng sông và phao nèo tàu biển, ô tô tải,cẩu hàng hỗ trợ cho vận tải tào thành dịch vụ trọn gói.

Trong 3 năm tới SOWATCO và các công ty thành viên, các liên doanh sẽ tiếp tục đầu tư các dự án: tiếp tục đầu tư phần thiết bị xếp dỡ chuyên dụng để khai thác, xây dựng kho bãi ICD 10 ha tại cảng Long Bình tại quận 9, TPHCM. Huy động nguồn vốn triển khai xây dựng 2 kho còn lại để hoàn thiện hệ thống kho với tổng diện tích 11.000m2 tại khu kho tiếp vậnSOWATCO tại khu đất Xí nghiệp CK 78 cũ. Đóng mới là 10 sà lan tựu hành 800 TPT/chiếc và 2 tàu lai dắt biển công suất 2500 mã lực/chiếc. Công ty liên doanh Keppel Land Watco đầu tư dự án xây dựng một khách sạn đạt tiêu chuẩn quốc tế 5 sao với vốn đầu tư là 42.629.756 USD và Công ty liên doanh phát triển tiếp vận số 1 sẽ đầu tư nâng công suất từ 400.000 TEU/năm lên 600.000 TEU/năm với vốn đầu tư là 30 triệu USD.

Những nhân tố ảnh hưởng đến kết quả kinh doanh của SOWATCO trong 3 năm qua: theo báo cáo tài chính hợp nhất kiểm toán 2007, với tổng tài sản là 920.609.344.458 đồng và vốn chủ sở hữu là 641.897.501.961 đồng, lợi nhuận sau thuế ở mức tương đối là 55.389.193.828 đồng do các nguyên nhân sau: SOWATCO góp vốn lớn vaofcacs liên doanh như góp 20.531.184,64 USD vào Công ty liên doanh Keppel Land Watco, góp 5.920.000 USD vào Công ty liên doanh phát triển tiếp vận số 1, góp 428.520 USD vào Công ty liên doanh Sơn ICI Việt Nam. Do vậy vốn trực tiếp tham gia vào hoạt động sản xuất kinh doanh tại SOWATCO là tương đối ít. Hơn nữa các  công ty liên doanh chưa tạo ra nhiều lợi nhuận cho SOWATCO, đặc biệt là Công ty Liên doanh Keppel Land Watco với vốn góp lớn nhưng đến nay vẫn trong giai đoạn lỗ theo kế hoạch (kế hoạch lỗ 12 năm kể từ năm 1997). Trong các năm 2004,2005,2006 chỉ có Công ty liên doanh sơn ICI Việt Nam chia lợi nhuận.Tuy nhiên, từ năm 2007 lợi nhuận được chia từ các công ty liên doanh sẽ tăng dần vì Công ty liên doanh Phát triển Tiếp vận số 1 và Công ty liên doanh sơn ICI Việt Nam sẽ chia lợi nhuận, Công ty liên doanh keppel Land Watco bắt đầu có lãi.

Theo báo cáo tài chính hợp nhất kiểm toán 2007 của SOWATCO, nợ vay ngắn hạn là 105.765.808.218 đồng và nợ vay dafihanj là 64.464.553.397 đồng, do vậy lãi phải trả của SOWATCO là tương đối lớn, điều này làm tăng chi phí rất nhiều. Hiện nay, các coongty cổ phần mà SOWATCO góp vốn đầu tư có kết quả kinh doanh chưa đạt hiệu quả nên chưa đóng góp nhiều vào lợi nhuận của SOWATCO. Nguyên nhân là vốn điều lệ tại các công ty cổ phần quá thấp nên không có lợi thế cạnh tranh.

Theo phân tích của SWOT,SOWATCO có một số điểm yếu: thiếu tài chính để đầu tư cho thiết bị, đội tàu, vốn đầu tư dàn trải, tập trung nhiều trong các liên doanh, tỷ suất lợi nhuận/vốn không cao, hoạt động marketing yếu, quản lý còn chồng chéo. Thời gian tới SOWATCO sẽ phải đối mặt với những nguy cơ: sự cạnh tranh không lành mạnh của các hãng vận tải tư nhân, sự cạnh tranh gay gắt và các rào cản tham gia thị trường thấp, áp lực giảm giá cả dịch vụ vận tải, cảng, không có sự đa dạng các loại khách hàng, chưa có chính sách rõ ràng để phát triển giao thông đường thủy do đó SOWATCO không thể lập đượckế hoạch tốt trong tương lai.